Dưới sự chỉ đạo của Shinbo Akiyuki, hãng phim hoạt hình Shaft đảm trách công việc sản xuất anime cho bộ manga này, trong khi bộ Negima gốc thì do hãng XEBEC. thực hiện. Tuy nhiên, 3 tập phim đầu có bao trùm những chương nói về câu chuyện của nhân vật Evangeline trong tập 3 manga gốc và tập 6,7,8 của anime gốc.

Với mạch truyện và cảm hứng giống với anime kế trước của Shinbo, Pani Poni Dash!, Negima!? chứa đựng rất nhiều lời văn nhại (parody) và có nhiều chi tiết ảnh hưởng bởi văn hóa đại chúng. Rất nhiều những chi tiết này xuất hiện trên bảng viết phấn trong những cảnh dạy học. Khá nhiều cảnh eyecatch và những cảnh omake mang tính hài hước trong phần cuối của mỗi tập phim cũng mang nặng tính parody là chính. Việc sử dụng những lời văn nhại càng làm tăng thêm tính hài hước vốn có của loạt anime này.

Vì Negima!? có thể coi như là một "phiên bản" khác của Negima gốc, nhiều chi tiết của anime Negima!? khá giống trên các chi tiết tương tự của phiên bản anime gốc. Có những chi tiết của Negima!? được sáng tạo dựa nên phiên bản gốc ví dụ trang phục của nhân vật Chiu, nhưng cũng có những chi tiết lấy hoàn toàn từ bản gốc như bài hát mở đầu của phiên bản gốc Happy Material xuất hiện trong những lúc hàng loạt các thẻ bài Pactio được kích hoạt.

Trái với phiên bản gốc, các chi tiết kích dục (ecchi) được hạn chế tối đa và thường chỉ xuất hiện ở những cảnh hoặc là vô tình hoặc là hài hước không đặt nặng giới tính. Ví dụ, Setsuna đã để lộ quần bó ngắn màu đen mặc dưới váy khi cô va vào tủ đựng chén. Hay trong một cảnh khác, ban đầu người xem lầm tưởng các nhân vật Mana, Zazie, Sayo, and Kazumi đang đi tắm, nhưng sau đó mọi người nhận ra rằng thực ra họ đang khám xét căn phòng tắm. Những bộ trang phục của Kazumi và Zazie chỉ để lộ đôi vai của họ, còn trang phục của Mana chỉ để lộ phần cơ thể ở dưới ngực và trên thắt lưng. Tuy nhiên những phiên bản phát hành dạng DVD của phim tỏ ra thoải mái hơn đối với những cảnh ecchi và những cảnh đệm, ví dụ như phiên bản DVD có xuất hiện như những cảnh nhân vật khỏa thân khi đang thực thi phép biến đổi của những thẻ bài Neo-Pactio, và có một số cảnh hài hước mang chất đồng tính nữ về Konoka và Setsuna.

Vì hệ thống nhân vật quá lớn nên đôi lúc trong anime xuất hiện một số cảnh phim ngắn với mục đích để những nhân vật trong anime đều được xuất hiện trên màn ảnh nhỏ. Thông thường hiếm khi chỉ một nhân vật xuất hiện trong các cảnh này, họ thường xuất hiện theo nhóm. Và anime cũng có nhiều đoạn ngoại truyện, thường là không liên quan đến mạch truyện chính. Một số chủ đề, mẩu chuyện tiếu lâm, và mô típ xuất hiện nhiều lần trong suốt bộ phim. Nhiều đoạn trong số này là các đoạn phụ, ít có liên quan đến mạch truyện chính của anime.